En 1985, Komoto Hiroto (chant), Mashima Masatoshi(guitare), Kawaguchi Junnosuke (basse) et Kajiwara Tetsuya (batterie) ont commencé le groupe. Ils ont très rapidement acquis une certaine renommée sur la scène punk japonaise grâce à leurs concerts dans différents clubs de Tokyo. L'année 1987 marque la sortie de leur premier album éponyme.
Alors qu'ils enregistraient leur troisième album, ils eurent des gros problèmes avec leur label Meldac, qui faisait partie d'un conglomérat de diverses entreprises, dont Mitsubishi. Cette société faisait des affaires dans le milieu de l'énergie nucléaire et le groupe voulait justement sortir sur leur album une chanson contre l'utilisation de l'énergie nucléaire, sous le titre de Chernobyl. Le groupe se retrouva face à un choix : soit il retirait la chanson de l'album soit il quittait le label. Il choisit la seconde option, et c'est alors que les médias s'emparèrent de l'affaire, faisant une telle publicité pour cet album qu'il se vendit bien mieux que les deux précédents.
A partir de ce moment, le groupe ne joua plus de concerts dans des petits clubs, puisque maintenant il était capable de remplir des vraies salles de concert. En 1990, il tenta de percer aux États-Unis, tentative avortée à cause du peu d'intérêt qu'elle provoqua. Le fait de sortir des disques spéciaux pour les États-Unis, de passer à la radio et de recevoir des critiques élogieuses de la presse musicale ne changea malheureusement rien à l'affaire. Pour compenser, leur quatrième album waste hip, sorti par Warner remporta un franc succès dans leur pays d'origine.
Après encore quatre autres années de succès, avec l'adjonction d'un membre de session Shirai Mikio qui jouait du synthétiseur, THE BLUE HEARTS annonça leur séparation le 23 juin 1994. Leur concert d'adieu avait eu lieu quatre jours plus tôt. Junnosuke promit que les membres allaient tous composer des chansons solo qui seraient réunis sur une compilation. Le sort de ce projet est inconnu à ce jour.
Pendant les années qui suivirent, des nombreux tribute albums en hommage au groupe sortirent sur le marché, et un film a même été nommé d'après leur chanson la plus célèbre : Linda Linda.
Mais bien entendu, des musiciens talentueux ne pouvaient pas simplement prendre leur retraite, et c'est ainsi qu'on retrouva Komoto, Mashima, et Shirai au sein des The High Lows, qui continue à écrire de la musique dans une veine assez similaire à leur précédent groupe. Kajiwara devint le batteur de The 3Peace, un groupe qui marche encore bien aujourd'hui. Kawaguchi a changé d'orientation et s'est reconverti en tant que manager et producteur, et s'occupe de nouveaux artistes, comme Stripe Effect.
